Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GCC1Q96CN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GCC1Q96CN9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GCC1Q96CN9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GCC1Q96CN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms