Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FAM3DQ96BQ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
FAM3DQ96BQ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
FAM3DQ96BQ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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