Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
USP9XQ93008 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
USP9XQ93008 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP9XQ93008 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
USP9XQ93008 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.33■■□□□ 1
USP9XQ93008 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
USP9XQ93008 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
USP9XQ93008 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP9XQ93008 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP9XQ93008 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP9XQ93008 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP9XQ93008 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
USP9XQ93008 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
USP9XQ93008 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
USP9XQ93008 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP9XQ93008 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms