Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FNDC8Q8TC99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FNDC8Q8TC99 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FNDC8Q8TC99 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms