Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
FNDC9Q8TBE3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FNDC9Q8TBE3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FNDC9Q8TBE3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNDC9Q8TBE3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms