Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MSL3Q8N5Y2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.54■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MSL3Q8N5Y2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MSL3Q8N5Y2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MSL3Q8N5Y2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms