Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ANKRD35Q8N283 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ANKRD35Q8N283 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ANKRD35Q8N283 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ANKRD35Q8N283 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms