Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SYNE4Q8N205 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SYNE4Q8N205 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SYNE4Q8N205 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SYNE4Q8N205 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SYNE4Q8N205 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms