Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHERPQ8IWX8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHERPQ8IWX8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHERPQ8IWX8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms