Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TREML1Q86YW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TREML1Q86YW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TREML1Q86YW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TREML1Q86YW5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms