Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SLC25A48Q6ZT89 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SLC25A48Q6ZT89 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SLC25A48Q6ZT89 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms