Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C16orf54Q6UWD8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
C16orf54Q6UWD8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C16orf54Q6UWD8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms