Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW49

SPESP1, Sperm equatorial segment protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPESP1Q6UW49 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPESP1Q6UW49 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPESP1Q6UW49 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPESP1Q6UW49 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms