Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIS1

SLC23A3, Solute carrier family 23 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC23A3Q6PIS1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC23A3Q6PIS1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC23A3Q6PIS1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC23A3Q6PIS1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC23A3Q6PIS1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms