Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTC27Q6P3X3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC27Q6P3X3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC27Q6P3X3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms