Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
C3orf33Q6P1S2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
C3orf33Q6P1S2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
C3orf33Q6P1S2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms