Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF20Q5VT98 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF20Q5VT98 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRAMEF20Q5VT98 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms