Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PDZK1Q5T2W1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDZK1Q5T2W1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PDZK1Q5T2W1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PDZK1Q5T2W1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 354.5 ms