Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC122Q5T0U0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
CCDC122Q5T0U0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCDC122Q5T0U0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms