Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CC2D1BQ5T0F9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CC2D1BQ5T0F9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CC2D1BQ5T0F9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CC2D1BQ5T0F9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms