Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM2

SNAPC4, snRNA-activating protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC4Q5SXM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
SNAPC4Q5SXM2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC40.21■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC40.19■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC40.19■■■■■ 4.03
SNAPC4Q5SXM2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC40.18■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SNAPC4Q5SXM2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
SNAPC4Q5SXM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC40.05■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC40.01■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SNAPC4Q5SXM2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SNAPC4Q5SXM2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SNAPC4Q5SXM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SNAPC4Q5SXM2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms