Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PHYHD1Q5SRE7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHYHD1Q5SRE7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms