Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQN1

SNAP47, Synaptosomal-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP47Q5SQN1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNAP47Q5SQN1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNAP47Q5SQN1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNAP47Q5SQN1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms