Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSZ5

PRRC2B, Protein PRRC2B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2BQ5JSZ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRC2BQ5JSZ5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRRC2BQ5JSZ5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRC2BQ5JSZ5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRC2BQ5JSZ5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms