Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRMT12Q53H54 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRMT12Q53H54 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRMT12Q53H54 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms