Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
C4orf17Q53FE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C4orf17Q53FE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C4orf17Q53FE4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms