Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ODF4Q2M2E3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ODF4Q2M2E3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ODF4Q2M2E3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms