Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TXNRD1Q16881 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TXNRD1Q16881 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TXNRD1Q16881 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TXNRD1Q16881 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TXNRD1Q16881 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
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