Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PCK2Q16822 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCK2Q16822 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PCK2Q16822 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
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