Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E2F4Q16254 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F4Q16254 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F4Q16254 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F4Q16254 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
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