Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITSN1Q15811 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ITSN1Q15811 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ITSN1Q15811 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ITSN1Q15811 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
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