Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RABEP1Q15276 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RABEP1Q15276 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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RABEP1Q15276 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
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RABEP1Q15276 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
RABEP1Q15276 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RABEP1Q15276 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
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