Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NECTIN1Q15223 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NECTIN1Q15223 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NECTIN1Q15223 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NECTIN1Q15223 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
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