Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRKD1Q15139 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRKD1Q15139 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRKD1Q15139 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
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