Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COL19A1Q14993 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
COL19A1Q14993 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
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COL19A1Q14993 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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COL19A1Q14993 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COL19A1Q14993 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COL19A1Q14993 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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