Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NEDD9Q14511 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NEDD9Q14511 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEDD9Q14511 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEDD9Q14511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
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