Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTR4Q13639 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HTR4Q13639 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HTR4Q13639 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HTR4Q13639 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms