Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALCOCO2Q13137 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CALCOCO2Q13137 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CALCOCO2Q13137 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
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