Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
KRTAP1-1Q07627 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP1-1Q07627 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
KRTAP1-1Q07627 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms