Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK18Q07002 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK18Q07002 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK18Q07002 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK18Q07002 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.5 ms