Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBE3AQ05086 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
UBE3AQ05086 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBE3AQ05086 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBE3AQ05086 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.3 ms