Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKCQQ04759 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKCQQ04759 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PRKCQQ04759 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRKCQQ04759 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms