Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PAX2Q02962 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PAX2Q02962 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms