Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK5Q00535 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK5Q00535 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms