Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO1P63165 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO1P63165 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO1P63165 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SUMO1P63165 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SUMO1P63165 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SUMO1P63165 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms