Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HERVK_113P63132 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HERVK_113P63132 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HERVK_113P63132 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms