Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RPS25P62851 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RPS25P62851 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RPS25P62851 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPS25P62851 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
RPS25P62851 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS25P62851 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS25P62851 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS25P62851 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPS25P62851 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPS25P62851 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPS25P62851 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS25P62851 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RPS25P62851 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS25P62851 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS25P62851 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS25P62851 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS25P62851 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPS25P62851 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS25P62851 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS25P62851 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS25P62851 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS25P62851 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPS25P62851 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms