Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
COPZ1P61923 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPZ1P61923 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPZ1P61923 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms