Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LINC00315P59091 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00315P59091 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms