Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUP107P57740 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP107P57740 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP107P57740 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUP107P57740 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUP107P57740 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUP107P57740 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP107P57740 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NUP107P57740 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NUP107P57740 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP107P57740 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NUP107P57740 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NUP107P57740 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP107P57740 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NUP107P57740 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NUP107P57740 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP107P57740 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP107P57740 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NUP107P57740 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NUP107P57740 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NUP107P57740 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms